En 2007 finalizó su contrato con el equipo, de modo que Rüştü, buscando ocupar de nuevo la titularidad, decidió irse libre a uno de los máximos rivales del Fenerbahçe, el Beşiktaş. Tras su retiro, Rüştü ejerce como directivo del Beşiktaş. Su participación en el club fue de más a menos, y para la temporada 2006-07, equipacion barça Volkan Demirel le había arrebatado tanto la titularidad en el club como en la selección turca.
