Después de la destacada participación del Bam Bam en Paraguay, el Emelec de Guayaquil adquirió su pase y logró debutar en primera división con 17 años de edad en 1992, el 7 de marzo, en un clásico del Astillero jugado en el Estadio George Capwell. Ese mismo año, Iván anotó el gol con que Emelec se coronó campeón. Al año siguiente, Iván vuelve a anotar el gol que le daba su segundo título de campeón consecutivo.